Curso de Diseño experimental y análisis Metagenómico utilizando supercomputación

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  • 09/11/2020
  • Lunes a Jueves 9:00 a 14:00 y de 15:30 a 18:30 horas. Viernes de 8:00 a 13:00 horas..
  • https://www.scayle.es/inscripcion/.
  • 1 semana.
  • 20.
  • 450

Este curso está destinado a profundizar en los métodos de análisis metagenómico para sacar todo el partido posible de las secuencias. La primera parte está enfocada en métodos de ensamblaje híbridos, combinando diferentes tipos de secuencias, especialmente secuencias largas y cortas. En a segunda parte se trabajará en profundidad con los resultados de binning, para poder recuperar con gran precisión genomas muy completos a partir del metagenoma. Se enseña como depurar los bins, como completarlos, y como combinar resultados de diferentes métodos. La tercera y última parte se centra en el análisis estadístico de los resultados, usando R para obtener asociaciones entre abundancias de taxones/genes/rutas metabólicas y tipos de muestra, por ejemplo condiciones ambientales o parámetros clínicos.